参考消息网4月22日报道 据西班牙《趣味》月刊网站3月11日报道，一直困扰着生物学家的一个问题是：我们能否实时观察生物体中每个分子在诞生、生长和分裂过程中的动态？这个看似不可能实现的显微镜技术，如今已成为首个对最小细胞进行完整4D模拟的突破性成果。

数十年来，生物学界一直梦想拥有这样一本“操作手册”：不仅能描述生命组分，更能展现它们每秒钟的物理交互过程。由赞恩·R.索恩伯格和安德鲁·迈廷领导的科研团队成功绘制了合成细菌JCVI-Syn3A的每项化学反应与物理运动。这项发表于美国《细胞》双月刊的研究显示，仅仅是为了理解这种简化生命体105分钟的运作过程，就耗费了六天的超级计算机运算时间，这充分证明生物学的复杂性远超当前人类的处理能力。

这项突破性研究促使科学站在了绝对个性化医疗的门槛上。由美国J.克雷格·文特尔研究所和伊利诺伊大学的一个研究组共同完成的这项研究意义重大，它能够追踪每个核糖体和脱氧核糖核酸(DNA)链的位置与功能。

数据表明，生命不仅是一份基因清单，更是一场分子编排的舞蹈。这些分子必须精确定位于特定空间，细胞才能成功分裂。

JCVI-Syn3A细菌是目前已知能在实验室中生长的最简单生物体，其基因组被精简至仅493个基因的最小规模。然而这种简单性具有欺骗性。为模拟其完整生命周期，研究人员不得不整合混合模型，将数学方程与空间动力学模拟相结合。主要发现表明，4D模拟技术能够预测传统实验无法观测的细胞特性，例如细胞质内代谢物的异质分布。

各位科学家利用多个图形处理单元(GPU)，逐原子追踪了DNA复制和蛋白质翻译等过程。结果表明，即使在最简单的生命体中，反应也并非无序发生，而是遵循特定的扩散模式。索恩伯格得出的结论是，空间组织是防止细胞代谢崩溃的关键机制，使资源能在细胞分裂的关键时刻精准抵达所需位置。

如此精细的细节揭示了为何迄今为止创建虚拟细胞如此之困难。如果一个拥有不到500个基因的生物体需要巨大的计算能力才能理解，那么绘制一个拥有约2万个基因的人类细胞的挑战就呈指数级增长。科学告诉我们，生物复杂性并非线性增长，而是每个新组件都会增加交互层，将哪怕是最先进的超级计算技术推向极限。

JCVI-Syn3A的模拟标志着一个时代的终结与另一个时代的开端。尽管机械模型能完美验证基础生物学真理，但研究表明，构建虚拟人类细胞的道路并非通过模拟每个原子，而是依靠数据驱动和人工智能的模型。研究人员强调，未来的机器学习模型或将预测细胞对药物或突变的反应，而此类模拟为其提供了必要的“坚实数据基础”。

这项发现的意义令人惊叹：首次获得了一个能像其生物对应物一样分裂的数字化身。科学家观察到三磷酸腺苷(ATP)消耗与脂质合成如何同步进行，从而使膜结构弯曲并分裂成两个新的生命单元。这一里程碑证明，数字生命能够复制现实世界的不可预测性，并在接触任何活体组织之前，为基因疗法提供可进行测试的虚拟实验室。

我们正站在理解生命最基本本质的第一步。索恩伯格及其团队的研究提醒我们：在细菌看似简单的表象之下，存在着精密得令人震撼的生命机制。模拟完整细胞的能力是对我们生物学认知水平的终极检验，并提醒我们：人类仍在学习解读那种让无生命物质获得生命并繁衍的密码。（编译/刘丽菲）